Universitas Islam Madura didirikan pada tanggal 18 April Tahun 1988, Universitas Islam Madura di bawah naungan Yayasan Universitas Islam Madura (YUNISMA) berdasarkan Akta Notaris A. Wahib Zainal, S.H Nomor 13 Tahun 1988 dan surat Rekomendasi Bupati Pamekasan tanggal 27 April 1988 Nomor 420.4/714/471.16/1988.
Program Studi D3 Kebidanan
Program Studi D3 Kebidanan didirikan pada tanggal 28 Agustus 2009 dengan ijin penyelenggara dari Departemen Pendidikan Nasional Direktorat Jenderal Pendidikan tinggi Nomor 1530/D/T/2009. Pada Tahun 2013 terakreditasi C dengan Nomor SK 155/SK/BAN-PT/AK/XIII/Dpl-III/VII/2013. Kemudian Pada Tahun 2018 terakreditasi B dengan nomor SK Nomor SK Akreditasi 0680/LAM- PTKes/Akr/Dip/IX/2018.
Program Studi D3 Farmasi
Program Studi D3 Farmasi merupakan salah satu Program Studi di lingkungan Universitas Islam Madura yang bernaung di bawah Yayasan Pondok Pesantren Miftahul Ulum Bettet Pamekasan Jawa Timur. Didirikan untuk memenuhi kebutuhan di kalangan masyarakat Madura sebagai fasilitas wadah di bidang pengembangan pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat di bidang kefarmasian berdasarkan Surat Keputusan Nomor 208/KTP/I/2016 yang dikeluarkan oleh Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi pada tanggal 23 Juni 2016.